Reconstrução e classificação de estruturas espaciais via otimização contínua : ênfase em proteínas / Reconstruction and classification of spatial structures via continuous optimization : emphasis on proteins
AUTOR(ES)
Rodrigo Silva Lima
FONTE
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia
DATA DE PUBLICAÇÃO
20/01/2012
RESUMO
Neste trabalho estudamos inicialmente o problema da reconstrução 3D de uma proteína dadas as distâncias entre pares de átomos de sua estrutura. Formulamos a situação como um problema de otimização não linear com função objetivo contínua no domínio de variáveis e mostramos através de experimentos computacionais que a estrutura original da proteína é recuperada mesmo quando admitimos conhecidas apenas um subconjunto de distâncias intra- átomos. Em seguida, estudamos problema da representação de um conjunto de proteínas comparadas em relação as suas estruturas tridimensionais. Propomos algumas formulações para este problema onde as proteínas são representadas por objetos em espaços euclidianos e elaboramos também um procedimento para classificar proteínas novas sem a necessidade de realizar exaustivas comparações estruturais envolvendo as proteínas analisadas
ASSUNTO(S)
otimização matemática programação não-linear imagem tridimensional proteins mathematical optimization nonlinear programming three-dimensional imaging proteinas - modelos matematicos
