Identificação de genes de referência para análise de expressão por PCR quantitativo em tempo real, em soja submetida à seca
AUTOR(ES)
Stolf-Moreira, Renata, Lemos, Eliana Gertrudes de Macedo, Abdelnoor, Ricardo Vilela, Beneventi, Magda Aparecida, Rolla, Amanda Alves Paiva, Pereira, Selma dos Santos, Oliveira, Maria Cristina Neves de, Nepomuceno, Alexandre Lima, Marcelino-Guimarães, Francismar Corrêa
FONTE
Pesquisa Agropecuária Brasileira
DATA DE PUBLICAÇÃO
2011-01
RESUMO
O objetivo deste trabalho foi validar, pela técnica de PCR quantitativo em tempo real (RT-qPCR) genes para serem utilizados como referência em estudos de expressão gênica em soja, em ensaios de estresse hídrico. Foram avaliados quatro genes comumente utilizados em soja: Gmβ-actin, GmGAPDH, GmLectin e GmRNAr18S. O RNA total foi extraído de seis amostras: três amostras de raízes em sistema de hidroponia com diferentes intensidades de déficit hídrico (0, 25, 50, 75 e 100 minutos de estresse hídrico), e três amostras de folhas de plantas cultivadas em areia com diferentes umidades do solo (15, 5 e 2,5% de umidade gravimétrica). Os dados brutos do intervalo "cycle threshold" (Ct) foram analisados, e a eficiência de cada iniciador foi calculada para uma analise da Ct entre as diferentes amostras. A aplicação do programa GeNorm foi utilizada para a avaliação dos melhores genes de referência, de acordo com a estabilidade. O GmGAPDH foi o gene menos estável, com o maior valor médio de estabilidade de expressão (M), e os genes mais estáveis, com menor valor de M, foram o Gmβ-actin e GmRNAr18S, tanto nas amostras de raízes como nas de folhas. Estes genes podem ser usados em RT-qPCR como gens de referência para análises de expressão gênica.
ASSUNTO(S)
glycine max estabilidade de expressão rt-qpcr déficit hídrico
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