Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.

AUTOR(ES)

HIGA, R. H.

FONTE

Campinas: Embrapa Informática Agropecuária

DATA DE PUBLICAÇÃO

2010

RESUMO

O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.

ASSUNTO(S)

agrupamento de dados expressão gênica rede genômica animal análise estatística análise de componentes principais - pca gene expression algorithms statistical analysis principal component analysis

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