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1. Genome sequence of the H2-producing Clostridium beijerinckii strain Br21 isolated from a sugarcane vinasse treatment plant
Abstract We report on the nearly complete genome sequence of Clostridium beijerinckii strain Br21, formerly isolated from a sugarcarne vinasse wastewater treatment plant. The resulting genome is ca. 5.9 Mbp in length and resembles the size of previously published C. beijerinckii genomes. We annotated the genome sequence and predicted a total of 5323 genes. S
Genet. Mol. Biol.. Publicado em: 31/01/2019
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2. In Silico Identification of MicroRNAs with B/CYDV Gene Silencing Potential
ABSTRACT Computational investigation of a set of publicly available plant microRNAs revealed 19 barley- and other plants-encoded miRNAs and their near-complement reverse sequences (miRNA*) that have potential to bind all B/CYDV open reading frames (ORFs) except ORF0 and ORF6. These miRNAs/miRNAs*, their binding positions and targets are discussed in the cont
Braz. arch. biol. technol.. Publicado em: 01/12/2016
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3. A protein expression system for tandem affinity purification in Xanthomonas citri subsp. citri
Abstract Citrus canker, caused by the Gram-negative bacterium Xanthomonas citri subsp. citri (Xac), is one of the most devastating diseases to affect citrus crops. There is no treatment for citrus canker; effective control against the spread of Xac is usually achieved by the elimination of affected plants along with that of asymptomatic neighbors. An in dept
Braz. J. Microbiol.. Publicado em: 2016-06
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4. small ORFs: A new class of essential genes for development
Genes that contain small open reading frames (smORFs) constitute a new group of eukaryotic genes and are expected to represent 5% of the Drosophila melanogaster transcribed genes. In this review we provide a historical perspective of their recent discovery, describe their general mechanism and discuss the importance of smORFs for future genomic and transcrip
Genet. Mol. Biol.. Publicado em: 2015-09
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5. Investigation of the association between clinical outcome and the cag pathogenicity-island and other virulence genes of Helicobacter pylori isolates from patients with dyspepsia in Eastern Turkey
The aims of our work were to determine the presence of the cag pathogenicity-island (cag PAI) and other virulence genes of Helicobacter pylori recovered from patients with gastritis and peptic ulcer, and to investigate the correlation of these virulence genes with clinical outcome. The presence of the cagA, the promoter regions of cagA, cagE, cagT, and the l
Braz. J. Microbiol.. Publicado em: 2013-12
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6. Identificação de genomas de um novo circovírus aviário / Detection of new avian circovirus genomes
A presente tese versa sobre estudos realizados visando a identificação de novos agentes virais em frangos comerciais. No primeiro capítulo, a identificação do girovírus aviário tipo 2 (AGV2) é reportada. Um genoma viral de 2383 nt foi amplificado a partir soros de frangos comerciais por amplificação randômica de DNA. A análise da sequência do pr
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 2012
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7. Clonagem dos genes putativos para prolina desidrogenase e D1-pirrolina-5-carboxilato desidrogenase de Leishmania (Leishmania) amazonensis e caracterização funcional de seus produtos. / Cloning of genes for putatives proline dehydrogenase and D1-pyrroline- 5-carboxylate dehydrogenase from Leishmania (Leishmania) amazonensis and functional characterization of their products.
Os tripanosomatídeos utilizam aminoácidos, particularmente a prolina, como fontes de carbono e energia. Essas moléculas estão também envolvidas em outros processos fisiológicos como a metaciclogênesis, osmorregulação, ou resistência a diferentes condições de estresse. Duas enzimas, prolina desidrogenase e D1-pirrolina-5-carb
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 28/09/2011
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8. Avaliação dos lipídeos de membrana e das ORFs dos contratransportadores Na+/H+ e Na+/Ca2+ associados a mecanismos de adaptação à halofilia em Halococcus morrhuae
Soil saliniy is a major factor in reducing plant growth and, consequently, their agricultural productivity. Most of the studies in the literature presents a strategy for reducing the effects of improving salt tolerance in plants for the production of osmolytes and stress proteins, and there are few studies aimed at increasing salt tolerance by restoring ioni
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 23/09/2011
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9. Avaliação dos lipídeos de membrana e das ORFs dos contratransportadores Na+/H+ e Na+/Ca2+ associados a mecanismos de adaptação à halofilia em Halococcus morrhuae
A salinização do solo é um dos principais fatores para redução do crescimento das plantas e, consequentemente, da sua produtividade agrícola. A maioria dos estudos presentes na literatura apresenta como estratégia para redução dos seus efeitos o melhoramento da tolerância a sal pelas plantas pela produção de osmólitos e proteínas de estresse, e
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 23/09/2011
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10. Caracterização estrutural e funcional de genes de degradação de hidrocarbonetos originados de metagenoma microbiano de reservatórios de petróleo / Structural and functional characterization of hydrocarbon degradation genes from microbial metagenome derived from petroleum reservoirs
A ocorrência de óleos biodegradados nos reservatórios de petróleo, juntamente com o isolamento das primeiras bactérias a partir destes ambientes, forneceu evidências de micro-organismos ativos no subsolo profundo. Os micro-organismos, habitantes comuns de reservatórios de petróleo, desenvolveram estratégias eficazes de biodegradação, baseados em s
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 11/07/2011
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11. Construção de biblioteca metagenômica de DNA microbiano do solo amazônico e prospecção de enzimas de interesse biotecnológico
Problemas relacionados a diminuicao dos estoques de combustiveis fosseis, politicos e ambientais tem levado a busca de alternativas renovaveis. A biomassa vegetal e abundante e barata, sendo candidata ideal para producao de biocombustiveis; entanto, o material lignocelulosico presente na parede celular das plantas possui estrutura complexa e atualmente nao e
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 30/06/2011
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12. Prospecção de genes codificadores de enzimas lipolíticas em biblioteca metagenômica de consórcio microbiano degradador de óleo diesel. / Screening for lipolytic enzyme codification genes in a metagenomic library of consortia specialized in diesel oil degradation.
As enzimas lipolíticas vêm atraindo atenção no mercado global devido ao enorme potencial biotecnológico, como: na formulação de detergentes; na indústria de couro; produção de cosméticos, fármacos, aromas, biodiesel, etc. O objetivo deste trabalho foi prospectar genes codificadores de enzimas lipolíticas em biblioteca metagenômica de um consór
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 03/03/2011