Seleção genômica para melhoramento vegetal com diferentes estruturas populacionais
AUTOR(ES)
Valente, Mágno Sávio Ferreira, Viana, José Marcelo Soriano, Resende, Marcos Deon Vilela de, Silva, Fabyano Fonseca e, Lopes, Maria Teresa Gomes
FONTE
Pesq. agropec. bras.
DATA DE PUBLICAÇÃO
2016-11
RESUMO
Resumo O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência da seleção genômica em diferentes cenários de estrutura populacional em milho-pipoca, com estimação dos efeitos e uso de marcadores na própria população de referência e em populações não relacionadas, e determinar a influência do tamanho efetivo e das relações de parentesco na população de estimação sobre a acurácia da predição. Foram simuladas populações com diferentes desequilíbrios de ligação (LD) e variâncias aditivas, tendo-se considerado diferentes caracteres, densidades de marcadores, herdabilidades e gerações, no total de 144 cenários. Também foram simuladas populações estruturadas em progênies. A acurácia da predição dos valores genéticos aditivos foi obtida por meio da correlação entre os valores paramétricos e os valores estimados por RR-BLUP (ridge regression-best linear unbiased prediction). Em populações com baixo LD e menor variância aditiva, o uso de maiores densidades de SNP (10 SNP 0,1 cM-1) é indicado, e, além disso, o candidato à seleção deve ser relacionado à população de estimação, para que a acurácia de predição seja satisfatória. O uso de população de seleção na mesma geração da população de estimação reduz em pelo menos 8% a acurácia. A estruturação da população em progênies de maior relacionamento e menor tamanho efetivo aumenta a eficiência da seleção genômica.
ASSUNTO(S)
zea mays acurácia da predição eficiência da seleção genômica predição de valor genético relação de parentesco tamanho efetivo
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