Desenvolvimento e aplicaÃÃo de um banco de dados de freqÃÃncias alÃlicas de marcadores STR na anÃlise genÃtica das raÃas bovinas holandesa e simental (bos taurus)

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DATA DE PUBLICAÇÃO

2002

RESUMO

Uma bateria de 11 marcadores microssatÃlites (STR â âShort Tandem Repeatsâ) detectados atravÃs de PCR (reaÃÃo de polimerase em cadeia) em sistema multiplex foi utilizada para analisar o polimorfismo de segmentos de DNA de bovinos. Amostras de sangue foram coletadas de animais criados na RegiÃo do Entorno do Distrito Federal, pertencentes Ãs raÃas taurinas Holandesa e Simental (Bos taurus L.). Todos os marcadores STR sÃo recomendados pela ISAG (International Society for Animal Genetics) para anÃlise genÃtica de bovinos. Os genÃtipos de cada um dos 11 locos STR (TGLA227; BM2113; TGLA53; ETH10; SPS115; TGLA126; TGLA 122; INRA23; ETH3; ETH225 e BM1824) foram obtidos simultaneamente em seqÃenciador automÃtico de DNA. Foram genotipados 99 indivÃduos da raÃa Holandesa e 100 indivÃduos da raÃa Simental. Os dados coletados foram utilizados para estimar a heterozigosidade observada e esperada nas amostras populacionais, identificando o nÃmero de alelos por loco e a proporÃÃo de locos polimÃrficos. Um banco de dados de freqÃÃncias alÃlicas em locos STR para estas duas raÃas bovinas foi construÃdo, abrindo a possibilidade de estimativa de parÃmetros genÃticos para animais destas raÃas pertencentes ao rebanho brasileiro. O comportamento da bateria de marcadores STR foi avaliado quanto à possibilidade de diferenciaÃÃo genÃtica de animais das raÃas Holandesa e Simental, e de classificaÃÃo racial de animais em uma ou outra raÃa com base nos genÃtipos observados em cada loco. O genÃtipo multiloco dos animais testados foi, neste caso, utilizado para estimar a probabilidade relativa de um indivÃduo ser incluÃdo em uma raÃa ou outra, tendo como referÃncia a distribuiÃÃo de freqÃÃncias alÃlicas de cada raÃa na identificaÃÃo individual de bovinos. A variabilidade genÃtica dos rebanhos tambÃm foi analisada. Os resultados obtidos indicam que a bateria de 11 marcadores à eficiente para a diferenciaÃÃo genÃtica das duas raÃa, bem como para a identificaÃÃo individual de animais da raÃa Holandesa e Simental. A estimativa de Probabilidade de Identidade baseadas na utilizaÃÃo do multiplex de 11 locos para a raÃa Holandesa à menor do que 1,81 x 10-12. Para a raÃa Simental, a Probabilidade de Identidade à menor do que 1,56 x 10-10. A probabilidade de dois animais taurinos apresentarem o mesmo perfil multiloco com esta bateria de STRs à menor do que 1 em 156 bilhÃes. A estimativa de Probabilidade de ExclusÃo de paternidade para a raÃa Holandesa variou de 0,330 a 0,707 (mÃdia= 0,574), com valor combinado da bateria de locos estimado em 99,994052%. A estimativa de Probabilidade de ExclusÃo de paternidade para a raÃa Simental variou de 0,221 a 0,676 (mÃdia= 0,490), com valor combinado da bateria de locos estimado em 99,957415%. Ou seja, a probabilidade de um falso reprodutor ser excluÃdo da possibilidade de ser o pai biolÃgico de um produto com a bateria de locos analisados à prÃxima de 100%. A genotipagem de DNA bovino baseada no sistema multiplex de 11 locos microssatÃlites estudado demonstrou ser funcional e adequada para animais das raÃas Holandesa e Simental.

ASSUNTO(S)

bovino endogamia str ciÃncias biolÃgicas marcadores moleculares frequencias alelicas

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