Comitês de grupamento aplicados a dados de expressão gênica

AUTOR(ES)

Shirlly Christiany Macedo Silva

DATA DE PUBLICAÇÃO

2006

RESUMO

O principal objetivo deste trabalho é investigar a viabilidade da aplicação de técnicas de combinação de agrupamentos (comitês de agrupamento) a dados de expressão gênica. Mais especificamente, serão realizados experimentos com três métodos diferentes de comitês de agrupamentos que vêm sendo bastante usados na literatura: matriz de coassociação, rerotulagem e votaao, e comitês baseados em particiona mento de grafo. A entrada para esses métodos de combinação serão as partições geradas por três algoritmos de agrupamento, os quais representam diferentes paradigmas: arquico com ligação k médias, ExpectationMaximization (EM), e o algoritmo hierárquico com ligação média. Todos esse algoritmos vêm sendo amplamente utilizados no contexto de dados de expressão gênica. De forma geral, os resultados obtidos indicam um desempenho superior das técnicas de comitês em relação as técnicas de agrupamento individuais, principalmente no contexto de comitês heterogêneos, isto é, comitês formados por partições base geradas por diferentes algoritmos de agrupamentos

ASSUNTO(S)

algorithms sistemas de computacao expressão gênica análise de grupamento gene expression algoritmo

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