Avaliação de marcadores AFLP corados com prata para estudar polimorfísmo de DNA em proso millet (Panicum miliaceum L.)

AUTOR(ES)

Karam, Décio, Westra, Philip, Niessen, Scott J., Ward, Sarah M., Figueiredo, José Edson Fontes

FONTE

Brazilian Journal of Botany

DATA DE PUBLICAÇÃO

2006-12

RESUMO

Proso millet (Panicum miliaceum L.) constitui uma séria praga agrícola na America do Norte. Grande número de biótipos de proso millet selvagens são conhecidos mas a base genética da variabilidade fenotípica é pouco conhecida. No presente estudo foi avaliado o método não radioativo, de coloração com prata, para visualizar fragmentos polimóficos de DNA amplificados por PCR (AFLP) visando estudo de polimorfísmo genético em biótipos de proso millet americano. Foram usados doze biótipos e oito combinações de primers com dois/três e três/três nucleotídeos seletivos. Pares de "primers" com dois/três nucleotídeos seletivos produziram maior número de fragmentos de DNA, enquanto que pares de "primers" com três/três nucleotídeos seletivos foram mais efetivos para revelar maior número de fragmentos polimórficos de DNA. As duas melhores combinações de "primers" foram EcoR-AAC/Mse-CTT e EcoR-ACT/Mse-CAA, que produziram, sete e onze fragmentos polimórficos de DNA, respectivamente. Em um total de 450 fragmentos de DNA amplificados, pelo menos 339 apareceram bem resolvidos em gel de poliacrílamida corado com prata e 39 bandas polimórficas de DNA foram escrutinadas. O nível de polimorfísmo de DNA (11,5%) usando apenas oito combinações de "primers" foi efetivo para agrupar biótipos de proso millet em dois clusters, mas insuficiente para separar biótipos híbridos de biótipos selvagens e cultivados. Entretanto, o presente resultado indicou que o método de coloração com prata poderá ser ferramenta barata e importante para estudar relações filogenéticas em proso millet.

ASSUNTO(S)

aflp diversidade genética marcadores moleculares proso millet

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