Automated Counting of Meloidogyne javanica Galls in Vegetable Roots

AUTOR(ES)
FONTE

Summa phytopathol.

DATA DE PUBLICAÇÃO

17/01/2020

RESUMO

RESUMO Os nematoides-das-galhas, gênero Meloidogyne spp., estão entre os parasitas mais destrutivos das plantas cultivadas. O sintoma mais característico da doença é o surgimento de galhas no sistema radicular. O uso da resistência genética é um dos mais eficientes, econômicos e menos impactantes do ponto de vista ambiental no controle desse endoparasita, sendo o índice de galhas uma das metodologias utilizadas para seleção de variedades resistentes. No entanto, é um método baseado na avaliação visual de galhas e, portanto, é uma técnica que exige tempo e é passiva de erros. Assim, este trabalho tem como objetivo desenvolver um método computacional automatizado para contar as gralhas de Meloidogyne javanica. O método proposto foi composto de cinco etapas: uma contagem humana visual de galhas, a aquisição de imagens de um scanner, otimização de parâmetros com base no conjunto de imagens e, finalmente, contagem das imagens. A raiz da alface produziu os melhores resultados, com 1% de erro relativo médio e a raiz do tomate o pior, com erro relativo médio de 32%. O erro relativo médio para todas as raízes testadas foi de 13%.ABSTRACT Root-knot nematodes, genus Meloidogyne spp., are among the most destructive parasites of cultivated plants. The characteristic symptom of this disease is gall formation in the root system. Genetic resistance is one of the most efficient and economic methods of minimal environmental impact to control this endoparasite, and gall index has been used to select resistant varieties. However, this method is based on visual assessment of galls and is therefore a time-consuming and error-prone technique. Thus, this study aims to develop an automated computational method for Meloidogyne javanica gall counting. The proposed method was composed of five steps: visual counting of galls, image acquisition by a scanner, optimization of parameters based on the image group and image counting. Lettuce root showed the best results, with 1% mean relative error, while tomato root had the worst result, showing 32% mean relative error. The mean relative error for all tested roots was 13%.

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