Amplificação por PCR e análises de seqüências de genes do tipo transcriptase reversa em isolados de Crinipellis perniciosa

Pereira, Jorge F., Ignacchiti, Mariana D.C., Araújo, Elza F., Brommonschenkel, Sérgio H., Cascardo, Júlio C.M., Pereira, Gonçalo A. G., Queiroz, Marisa V.

Amplificação por PCR e análises de seqüências de genes do tipo transcriptase reversa em isolados de Crinipellis perniciosa

AUTOR(ES)

Pereira, Jorge F., Ignacchiti, Mariana D.C., Araújo, Elza F., Brommonschenkel, Sérgio H., Cascardo, Júlio C.M., Pereira, Gonçalo A. G., Queiroz, Marisa V.

FONTE

Fitopatologia Brasileira

DATA DE PUBLICAÇÃO

2007-10

RESUMO

A análise de sequências de transcriptase reversa (RT) é uma etapa importante para descobrir a presença de elementos transponíveis e investigar o seu papel na geração de variabilidade genética em C. perniciosa. Seqüências putativas de TR foram analisadas no genoma do fitopatógeno C. perniciosa, o agente causal da doença vassoura-de-bruxa no cacau. Um fragmento de 394 pb foi amplificado a partir do DNA genômico de diferentes isolados de C. perniciosa, pertencentes aos biótipos C, L e S e a distintas áreas geográficas. A clivagem dos produtos de PCR com diferentes enzimas de restrição e sequenciamento de vários fragmentos de TR indicou a presença de diferentes seqüências mostrando eventos de transição G:C para A:T. A análise por hibridização revelou alto número de sinais sugerindo a presença de cópias de TR com diferentes perfis entre os isolados dos biótipos C, S e L. As comparações de seqüências dos peptídeos preditos indicam uma relação próxima com a proteína TR de retrotransposons-LTR da família gypsy.

ASSUNTO(S)

variabilidade genética transposons vassoura de bruxa theobroma cacao